Sciencemag.cz
Doporučujeme
Šlechtění rostlin usnadní v budoucnu nová metoda, kterou vytvořili vědci z katedry biochemie Přírodovědecké fakulty Univerzity Palackého v Olomouci. Díky ní je totiž možné snadněji rozpoznávat konkrétní geny zodpovědné za určité vlastnosti rostlin. Metoda pomůže výzkumným týmům zefektivnit analýzu vzorků rostlin a zároveň snížit náklady spojené s pořizováním vzorků. Olomoučtí vědci se ve svém výzkumu zaměřili na zvýšení využitelnosti informací o genomech rostlin a také na přesnější vyhodnocení takto získaných dat. Výsledky jejich odborné práce publikoval prestižní časopis Journal of Advanced Research.
Experti při zkoumání genetické struktury rostlin už delší dobu používají analýzu GWAS, která slouží k odhalování oblastí genomu zodpovědných za vybranou vlastnost rostlin. Identifikace konkrétních genů, ke kterým lze přiřadit zkoumanou vlastnost rostliny, ale byla dosud velmi neefektivní. Odborníkům z katedry biochemie se podařilo složitou analýzu zpřesnit a zrychlit. Zavedli do ní další hodnoticí parametr takzvané přesnosti.
„Díky parametru přesnosti lze zjistit, která mutace v oblasti genomu nejvíce souvisí se zkoumanou vlastností rostliny neboli fenotypem. Bez zavedení tohoto nového parametru měl výsledek dosavadní analýzy často podobu dlouhého seznamu čítajícího stovky genů, mezi kterými bylo takřka nemožné rozlišit, který je ten pravý. My jsme nyní analýzu obohatili o možnost rychle najít v pomyslné kupce sena onu příslovečnou jehlu,“ podotkla Mária Škrabišová z katedry biochemie olomoucké přírodovědecké fakulty.
Dosud používané výzkumné metody jsou buď drahé, zdlouhavé a náročné na vyhodnocování dat, nebo odhalí často pouze zlomek informací o genetické variabilitě rostliny, případně limitují vědce při výzkumu množstvím využitelných vzorků a jejich kvalitou. Díky parametru přesnosti mohou nyní odborníci využít výsledky mnoha už dříve publikovaných experimentů, které jsou v současnosti ve šlechtitelství veřejně dostupné a dosud byly využívány jen velmi omezeně. „Unikátním způsobem jsme umožnili propojení dvou přístupů získávání genotypizačních dat a zároveň jsme pomohli výzkumným týmům s rozhodnutím, do jakých výzkumných postupů mají dále při své vědecké práci investovat peníze,“ doplnila Mária Škrabišová.
Na výzkumu v oblasti genomiky vědci z olomoucké katedry biochemie dlouhodobě spolupracují s kolegy z University of Missouri ve Spojených státech amerických. Genomika je obor, který se zabývá studiem genomů organismů. Spadá sem především získávání sekvencí DNA organismů, její analýza a stanovení variability v rámci populace organismu nebo mezi druhy za účelem lepšího porozumění procesu evoluce nebo například vzniku nových geneticky podmíněných onemocnění.
