Foto: © palau83 / Dollar Photo Club

Rozsvěcující se nukleosid pro přímou vizualizaci syntézy DNA

V molekulární a buněčné biologii, stejně jako v medicínské diagnostice, se často využívá fluorescenčního značení biomolekul. Jednou z molekul, které je možno takto značit, je i DNA. Skupina vědců pod vedením Michala Hocka z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR vyvinula novou fluorescenční sondu právě pro DNA v podobě nukleosidu thymidinu nesoucího fluorofor, který jen velmi slabě fluoreskuje v blízké infračervené oblasti ve vodném prostředí. Ovšem po zabudování značeného nukleotidu do DNA enzymem DNA polymerázou se rozsvítí i několikasetnásobně, protože navázaný fluorofor interaguje se skupinami ve velkém žlábku DNA.

Díky tomuto značení je tedy možné přímo sledovat a vizualizovat probíhající syntézu DNA, stejně jako následné změny její sekundární struktury nebo interakce s jinými molekulami ve velkém žlábku, kdy značka opět zhasíná.

Přestože je kvůli toxicitě značeného nukleotidu nová metoda zatím omezena na práci mimo živé buňky, tkáně a organismy, její použitelnost byla ověřena při real-time PCR detekci RNA viru SARS-CoV-2.

Syntézu nové značky i studii jejího využití vědci publikovali v časopise Chemistry – A European Journal, umělecké ztvárnění obsahu jejich studie se dostane i na jeho obálku.

Kuba, M.; Kraus, T.; Pohl. R.; Hocek, M.: „Nucleotide bearing benzylidene-tetrahydroxanthylium near-IR fluorophore for sensing DNA replication, secondary structures and interactions“ Chem. Eur. J. 2020, doi: 10.1002/chem.202003192.

převzato z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR

Modré mládě krasky krátkoocasé jávské se svým rodičům zbarvením zatím moc nepodobá. Foto: Miroslav Bobek, Zoo Praha

Proč příroda nevytváří červenou pomocí rozptylu světla?

Živé organismy své barvy tvoří cca dvěma hlavními způsoby – pomocí pigmentů a jako tzv. …

Napsat komentář

Vaše emailová adresa nebude zveřejněna. Vyžadované informace jsou označeny *

Používáme soubory cookies pro přizpůsobení obsahu webu a sledování návštěvnosti. Data o používání webu sdílíme s našimi partnery pro cílení reklamy a analýzu návštěvnosti. Více informací

The cookie settings on this website are set to "allow cookies" to give you the best browsing experience possible. If you continue to use this website without changing your cookie settings or you click "Accept" below then you are consenting to this.

Close