Aminokyseliny si dnešní autotrofní živé organismy vytvářejí z alfa-ketokyselin a ze zdroje dusíku (u organismů neschopných fixace vzdušného N2 je to dusičnan nebo amonná sůl) za pomoci enzymů. α-ketokyseliny pravděpodobně existovaly již v rané historii Země. V době před vznikem života ale sotva byly k dispozici enzymy v dnešní podobě. …
více »Namísto RNA světa měla od počátku života fungovat koexistence RNA s peptidy
RNA svět představuje vlivnou teorii popisující vznik pozemského života a otázku, zda byla dříve DNA nebo proteiny. RNA v tomto – částečně i experimentálně potvrzeném – modelu může hrát roli jak enzymu, tak i nosiče genetické informace, tj. zařídit si sama vlastní replikaci. Problém slepice a vejce by se tak …
více »Vznik a evoluce genetického kódu
Genetický kód jistě nevznikl najednou ve své současné podobě. Především se zdá pravděpodobné, že ze dvaceti běžných aminokyselin se počátečního formování organického biosvěta účastnila asi jen polovina (Gly, Ala, Asp, Glu, Val, Ser, Ile, Leu, Pro, Thr), zatímco ty ostatní, s odvozenějšími a složitějšími dráhami syntézy, se přidávaly později. Naopak, …
více »Nový pohled na vývoj raných interakcí mezi proteiny a RNA
Interakce mezi RNA a peptidy/proteiny jsou pro život nesmírně důležité již od jeho nejranějších forem, dokonce ještě před posledním univerzálním společným předkem (LUCA). Komplexy protein-RNA jsou v moderním životě všudypřítomné a jsou nezbytné pro mnoho fází buněčného cyklu a metabolismu. Nový výzkum přináší experimentální podklady, které poskytují nový pohled na …
více »Jak se zbavit methioninu
Methionin je esenciální aminokyselinou, takže nějaký jíst musíme. Jenže se zdá, že čím méně, tím lépe, alespoň za určitých okolností. Problém je, že methionu se těžko vyhýbat, je obsažen v produktech živočišného původu, ale třeba i v semenech, obilninách apod. Thomas W. Gettys z Pennington Biomedical Research Center uvádí, že …
více »Alzheimerovu chorobu by mohly léčit obyčejné aminokyseliny
Alzheimerovu chorobu by mohly způsobovat změny v metabolismu mozku. K takovému závěru dospěla alespoň studie vědců z Chinese University of Hong Kong. Výzkumný tým zjistil, že konkrétní varianta genu (jednonukleotidový polymorfismus v genu LRP6) způsobuje, že astrocyty (podpůrné buňky v mozku) mozku vyčerpávají aminokyseliny, které jsou nezbytné pro správný přenos …
více »Při vzniku života sehrál významnou roli cystein
Dosud se soudilo, že cystein, jedna z 20 aminokyselin tvořících proteiny, může abiotickými cestami vznikat jen dost obtížně. Často se proto předpokládalo, že na počátku života tato aminokyselina neexistovala a nebyla kódována v genomu – nakonec i samotný genetický kód je nejspíš výsledkem postupné evoluce. Viz také: Evolučně nejstarší aminokyseliny: …
více »Čím je cítit durian? Ethioninem
Durian, tropický strom, respektive jeho stejnojmenný plod, je v jihovýchodní Asii oblíbený i přes svůj pronikavý zápach, mnohdy charakterizovaný jako shnilá cibule. Vědci z Technické univerzity v Mnichově nyní došli k závěru, že základní složkou zápachu durianu je vzácná aminokyselině ethionin a její deriváty. Hlavním pachatelem je zřejmě ethioninthiol, který …
více »Na MITu navrhují proti koronaviru obyčejný peptid
Může k odzbrojení viru stačit sekvence 23 aminokyselin kopírující kousek kritického receptoru na lidských buňkách? Profesor chemie Brad Pentelute z MITu a jeho kolegové chtějí blokovat schopnost koronaviru vstupovat do lidských buněk. Krátký peptid totiž reaguje s proteinem, který virus používá jako klíč k proniknutí do buňky. Zjištění bylo prozatím …
více »Vědci zhudebnili proteinové molekuly pro umělou inteligenci
Hudbu chtějí vědci využít pro výcvik strojových algoritmů schopných navrhovat novou „proteinovou hudbu“, kterou pak bude možné zpětně měnit na nové proteinové struktury. Fyzici z MIT vyvinuli systém, který dokáže převádět molekuly proteinů na hudbu. Doufají, že s jeho pomocí lépe pochopí, jak proteiny fungují, a budou moci vytvořit zcela …
více »