Genetici a bioinformatici už asi 40 let používají k porovnávání sekvencí DNA tzv. Wagner-Fischerův algoritmus. Tímto způsobem lze zjistit minimální počet elementárních operací, jimiž jednu sekvenci dokážeme přeměnit na druhou, tedy rozdílnost obou řetězců. Za elementární operace považujeme vložení nebo smazání „písmene“ nebo jeho přepis za jiné písmeno. (Poznámka: někdy …
více »Dvoukrokový mechanismus pro úpravu RNA
Nový objev může být klíčem k porozumění vzniku autoimunitních onemocnění u člověka. Dlouhodobá spolupráce mladého molekulárního biologa Zdeňka Parise z Parazitologického ústavu Biologického centra AV ČR s kolegy ze dvou laboratoří v USA přinesla brilantní výsledek – objev dvoukrokového mechanismu pro úpravu RNA, která se zúčastňuje tvorby bílkovin v buňce. …
více »Nová krátká a efektivní metoda syntézy nukleosidů
Nukleosidy jsou nejen základními stavební kameny nukleových kyselin a tím i života, ale jsou využívány i v medicíně jako protivirová a protinádorová léčiva. Bohužel současné metody syntézy a výroby syntetických i přirozených nukleosidů jsou obvykle velmi neefektivní, pracné a zdlouhavé procesy, které jsou často neselektivní (vedou ke směsím produktů) a …
více »Vědci získali mitochondriální DNA Boženy Němcové
Výsledky výzkumu neodpovídají na spekulativní otázky o původu Boženy Němcové. Po dvouletém komplexním výzkumu zahájeném v lednu 2015 vydal mezioborový tým stěžejní oznámení. Členy týmu, vedeného Milanem Horkým, ředitelem Muzea Boženy Němcové v České Skalici, jsou odborníci z Filozofické fakulty Univerzity Karlovy, Památníku národního písemnictví, laboratoří Genexone, s. r. o., …
více »První stabilní polosyntetický organismus
Dalo by se to říct i jinak: metoda CRISPR dokázala udržet vložené umělé báze DNA tak, aby z genomu nevypadly. Následující experiment provedli na The Scripps Research Institute (TSRI). Výsledky byly publikovány Proceedings of the National Academy of Sciences, hlavním autorem práce je profesor Floyd Romesberg. Již v roce 2014 …
více »Británie jako první na světě povoluje počít dítě s DNA tří dárců
Británie se dnes oficiálně stala první zemí na světě, která výslovně povoluje počít dítě s genetickými informacemi od tří dárců. Uvedla to agentura DPA. Ratifikační proces, který začal loňským souhlasem parlamentu, dnes ukončil úřad pro fertilizaci a embryologii HFEA, který metodu schválil. Úprava buněk umožňuje předejít přenosu některých genetických onemocnění …
více »Alternativa pro RNA svět
Další výzkum na Scripps Research Institute ukazuje, že kombinace RNA a DNA mohla stát už na počátku pozemského života. Jedná se tak o alternativu k teorii RNA světa, kterou na této instituci rovněž podrobně zkoumají. Viz také: RNA svět by po 4 miliardách let mohl zase začít fungovat Základem nového …
více »Éra exponenciálního růstu a budoucnost firem
Za pár let bude sekvenování DNA levnější než spláchnutí záchodu, bude se tedy provádět současně? „Pokud něco měníte v korporaci, měli byste očekávat, že na vás její imunitní systém zaútočí.“ I když to tak mohlo zpočátku vypadat, podvečerní úterní plenární přednáška „mastermind“ Salima Ismaila vlastně až tak moc o korporacích nebyla. …
více »Zelí vytvořené technikou CRISPR poprvé na talíři
CRISPR a její mnohé varianty představuje techniku pro editování genomů, o níž se mluví především v souvislosti s cíleným křížením, respektive opravou vadných genů. Technologie CRISPR-Cas9 je vypůjčena od bakterií, které ji používají pro ochranu před cizími genetickými elementy. Bakterie se takto dokážou naučit rozpoznat konkrétní místo v cizorodém genomu …
více »Virus jedovatý jako černá vdova
Malý bakteriofág má v genomu sekvenci pro toxin, který produkuje pavouk černá vdova. K čemu něco takového viru vůbec může být dobré? Biologové z Vanderbilt University objevili příslušnou sekvenci u bakteriofágu WO. To na první pohled vůbec nedává, i kdyby tento fág kradl geny svému hostiteli, šlo by o sekvence …
více »