Sciencemag.cz
Doporučujeme
Virologové z Ústavu molekulární biologie rostlin Biologického centra AV ČR popsali během loňského roku pět nových virů. K jejich hledání používají českobudějovičtí biologové i nejmodernější sekvenování nové generace (NGS). „Vlastně nejprve rozstříháte Shakespearův román, do toho několik dalších knih, přimícháte stejně rozstříhané kratší povídky, okořeníte krátkými vtipy, vše důkladně promícháte a pak se snažíte všechno zase správně poskládat. Sestavení kompletní dědičné informace virů, která se podobá těm rozstříhaným povídkám, tak může připomínat ono pověstné hledání jehly v kupce sena,“ popisuje Mgr. Ondřej Lenz, Ph.D.
Zatímco klasickým sekvenováním bylo možné „přečíst“ jen předem vybrané krátké kousky dědičné informace, technologie NGS dovede najednou zobrazit veškerou dědičnou informaci obsaženou v daném zkoumaném vzorku. Jak vysvětluje virolog Ondřej Lenz z Biologického centra AV ČR, není to ale zas tak jednoduché, protože získaná informace je „rozstříhaná“ na menší kousíčky o cca 100–150 písmenkách a ty je nejprve potřeba správně složit.
Když se ale zadaří, je možné odhalit nejen známé viry, ale i ty, které se množí bez zjevných příznaků virové infekce, či viry, které dosud nebyly popsány vůbec. To se stalo i v tomto případě. Nově objevené viry se množí v rybízu, třešních a mikroskopických houbách a ukazují, že virový svět je mnohem rozmanitější, než jsme si doposud mysleli.
