Credit: Jevgenij Raskatov, UC Santa Cruz

Sestavili protein složený z pravotočivého i levotočivého řetězce

Jednou z nejběžnějších forem sekundární struktury proteinu je tzv. beta-list (skládaný list). Primární struktura znamená vlastní sekvenci aminokyselin sekundární pak to, jak jsou vlákna dále uspořádána. V beta listu tvoří vlákna dvojrozměrnou strukturu, kterou mezi vlákny udržují vodíkové vazby. Jinou známou strukturou je šroubovice (alfa-helix).
Vědci z Kalifornské univerzity v Santa Cruz vytvořili ale nyní něco zvláštního – sestavili k sobě vlákna zrcadlových obrazů („levo/pravotočiných“, L/D). Nemůžeme sice mluvit přímo o proteinu, protože obě vlákna obsahují jen tři aminokyseliny (trifenylalanin složený ze 3 molekul fenylalaninu).
Zajímavé je, že Linus Pauling a Robert Corey popsali tuto formu beta-listu (ripplet sheet) již v roce 1953 spolu s běžnou formou skládaného listu, pak ale strukturu dále nikdo nezkoumal a její existence byla vlastně jen teoretická. Nová studie ale uspořádání (viz obrázek) potvrdila i pomocí snímků z rentgenové krystalografie. Ukázalo se, struktura přesně odpovídá předpovědím Paulinga a Coreyho. Zajímavé má být i to, že se sestavila sama, stačilo smíchat L a D formu peptidu v poměru 1 : 1. V přírodě se nic podobného nevyskytuje, i když samotné D aminokyseliny ano (buněčné stěny bakterií, antibiotika, hadí jedy…).
Nový objev umožňuje rozšířit způsoby, jimiž skládáme peptidové a polypeptidové struktury. Kdoví, k čemu všemu dokážou syntetičtí biologové toto využít (poznámka PH: tedy pokud se podaří skládat takto k sobě i další a delší/různorodější zrcadlově obrácené peptidy).
Ariel J. Kuhn et al, A crystal-structural study of Pauling–Corey rippled sheets, Chemical Science (2021). DOI: 10.1039/d1sc05731f
Zdroj: University of California – Santa Cruz / Phys.org a další

Poznámky PH:
Chápu doufám dobře, že nejde jen o složení z různých optických izomerů, ale že onen „překřížený“ složený list je něco jiného než normální antiparalelní uspořádání beta-listu?
Ono „pravotočivé“ a „levotočivé“ v titulku je konvence/synonymum pro D a L formu, neodpovídá to skutečnému stáčení světla, to pro každou opticky aktivní aminokyselinu platí jinak.

Grafenový sendvič otevírá cestu k nové třídě sloučenin

Z množství známých molekul se ve formě 2D vrstev prozatím daří připravit jen malou část. …

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna. Vyžadované informace jsou označeny *

Používáme soubory cookies pro přizpůsobení obsahu webu a sledování návštěvnosti. Data o používání webu sdílíme s našimi partnery pro cílení reklamy a analýzu návštěvnosti. Více informací

The cookie settings on this website are set to "allow cookies" to give you the best browsing experience possible. If you continue to use this website without changing your cookie settings or you click "Accept" below then you are consenting to this.

Close