Archiv článků: proteiny

Achillovou patou koronaviru může být posun čtecího rámce

Nejen proti koronaviru, ale i proti dalším virům by mohl chránit zajímavý mechanismus regulující přepis RNA do proteinů. Jak známo, trojici bází v mRNA odpovídá aminokyselina v proteinu. Viry však často využívají posun čtecího rámce. Protože mají relativně malý genom, zvyšují množství kódovaných proteinů tím, že některé sekvence lze číst …

více »

Neviditelné elektrické sítě z bakterií

Oceánské dno a částečně i povrch pevnin jsou protkány sítěmi bakterií, které dokáží generovat elektrický proud z organického odpadu. Za normálních okolností je tato elektrická síť skrytá, ale jednorázový impulz vnějším elektrickým polem by ji mohl aktivovat. Nikhil Malvankar z Yale, hlavní autor studie publikované v Nature Chemical Biology, uvádí, …

více »

Molekuly proteinů v buňkách fungují jako miniaturní antény

3d struktura proteinů, zdroj: Wikipedia, licence obrázku public domain

Vědci připravili bakterie s fluorescentními proteiny. Vědci pod vedením Josefa Lazara z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR (ÚOCHB) prokázali, že molekuly fluorescentních proteinů se chovají jako antény, jejichž optické vlastnosti, tedy to, jak dokáží pohlcovat a vyzařovat světelné záření, závisí na jejich prostorové orientaci. Fluorescentní proteiny, původně objevené …

více »

Rekord: kryoelektronová mikroskopie zobrazila jednotlivé atomy vodíku v proteinu

Pomocí kryoelektronové mikroskopie se vědcům podařilo zobrazit molekulu proteinu apoferritinu v rozlišení 1,25 angstromů (angstrom je desetimiliontina milimetru, 10 na -10 metru). Úspěchu dosáhl tým, který vedl Holger Stark z Max Planck Institute for Biophysical Chemistry v Göttingenu. Za kryoelektronovou mikroskopii získali Jacques Dubochet, Joachim Frank a Richard Henderson v …

více »

Unikátní fluorescenční technika umožňuje zobrazit proteinové komplexy

Procesy vedoucí k hojení ran či buněčné smrti. Seskupování molekul do funkčních proteinových komplexů je zcela zásadní pro správné fungování mnoha biologických procesů. Týmu Radka Šachla se podařilo vyvinout pokročilou fluorescenční techniku, která umožňuje jednotlivé proteinové komplexy detekovat, určit jejich složení a zjistit, zda správně plní svojí funkci. „Za použití …

více »

Viry dokáží vytvářet kombinované proteiny z vlastních i hostitelových genů

Některé viry běžně kopírují geny svých hostitelů do svého genomu, tímto způsobem se občas realizuje i přenos genetické informace mezi různými druhy. Novinou publikovanou v časopisu Cell je nyní zjištění, že viry dokáží kousky své vlastní a hostitelovy genetické informace míchat tak, že na tomto základě pak syntetizují (respektive: virem …

více »

Vědci zachytili syntézu bílkovin v nebývalých detailech

Ribozomy spojí více než deset aminokyselin za sekundu, a právě proto představovala vizualizace tohoto procesu na téměř atomárním rozlišení velkou výzvu. Strukturní biolog Gabriel Demo vyvinul během svého působení na Lékařské fakultě Massachusettské univerzity spolu se svými kolegy nový postup umožňující vizualizaci syntézy bílkovin pomocí časově rozlišené kryo-elektronové mikroskopie (kryo-EM) …

více »

Vědci popsali strukturu proteinů COVID-19 vhodných pro návrh nových léků

Proces instalace čepičky katalyzuje koronavirový protein Nsp16 za spoluúčasti dalšího virového proteinu, Nsp10. COVID-19 změnil životy miliónů, či spíše miliard lidí na celém světě. Tuto nemoc způsobuje SARS koronavirus 2 (SARS-CoV-2), který patří mezi RNA viry, tj. používá RNA k uchování své genetické informace. Abychom mu mohli čelit, musíme do …

více »

Proti koronaviru přes snížení metabolismu proteinů i sacharidů

Řada virů v napadených buňkách zpomaluje až zastavuje syntézu hostitelových proteinů a namísto toho spustí výrobu proteinů viru; oba typy metabolických drah si konkurují. Na Goethově univerzitě ve Frankfurtu nad Mohanem ale nyní zjistili, že SARS-CoV-2 funguje jinak. Sandra Ciesek a její kolegové studovali chování viru pěstovaného na lidských buňkách …

více »